StatEL : Test exact de Fisher
 
Cette commande lance l'utilitaire vous permettant de procéder au calcul du p exact de Fisher pour la comparaison de 2 proportions.

1 - Principes du test exact de Fisher :

On dispose de 2 échantillons a et b dont les proportions des différentes modalités d'une variable qualitative sont des estimateurs des proportions de ces mêmes modalités dans les populations A et B d'où sont issus les échantillons. La question posée est : si les proportions sont différentes entre les 2 échantillons (ce qui est facile à vérifier), en est-il de même pour les 2 populations ?

Une autre façon de poser la question est de semander si les 2 échantillons sont issus d'une seule et même population ou bien de 2 populations différentes.

  • Hypothèse nulle : "H0 = pa et pb (proportions du paramètre p dans les 2 populations) sont égales"
  • Hypothèse alternative : "H1 = pa et pb sont différentes"

Le test exact de Fisher permet de calculer (dans l'hypothèse H0 d'équivalence entre les 2 groupes) la probabilité exacte d'obtenir, entre les 2 groupes, un écart dans la répartition des 2 modalités supérieur ou égal à celui observé (p unilatéral) ou différent de l'écart observé (p bilatéral).

Il est nécessaire de disposer d'un tableau de contingence à 4 cases (tableau 2X2) présentant les effectifs de 2 groupes de sujets présentant l'une ou l'autre des 2 modalités d'une variable qualitative.

test fisher

Le test consiste, à partir de la configuration de départ (en effectifs), à calculer toutes les configurations possibles présentant des écarts plus importants de la répartition des 2 modalités au sein des 2 groupes, tout en maintenant les totaux des lignes et des colonnes. Ainsi, dans notre cas de figure, on obtient "seulement" 2 nouvelles configurations :

test fisher

test fisher

La probabilité d'obtenir chacune des configurations identifiées se calcule par la formule suivante :

formule test fisher

Avec :

  • L1 et L2 les sommes des effectifs de chacune des 2 lignes
  • C1 et C2 les sommes des effectifs de chacune des 2 colonnes
  • a, b, c, d les effectifs directement tirés de chacune des 4 cases du tableau de contingence
  • N la somme des effectifs totaux


La somme de ces probabilités fournit la probabilité totale de rejeter à tort H0, c'est à dire la probabilité d'obtenir, entre les 2 groupes, un écart dans la répartition des 2 modalités, supérieur ou égal à celui observé.



2 - Lancement et résultats du test exact de Fisher :

A l'instar des procédures de calcul du nombre de sujets nécessaires, le calcul du p exact de Fisher s'effectue totalement à partir d'une boîte de dialogue (données + résultats) :

test fisher

Il vous suffit de remplir les 4 cases vacantes par les effectifs correspondants, puis de cliquer sur le bouton "Lancer le calcul". La boîte de dialogue se dévoile pour y faire apparaître les résultats sur sa partie droite :

reultats test fisher


Cochez la case relative aux Risque Relatif et Odds Ratio afin d'en faire apparaître également les résultats.


 

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