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StatEL : Courbes de Survie |
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Cette commande lance la procédure de construction d'une courbe de survie par la méthode actuarielle ou par la méthode de Kaplan-Meier :
- la méthode actuarielle est préférée lorsque les effectifs étudiés sont importants car elle divise la durée totale de l'étude de survie en intervalles réguliers et établit les "comptes" des décès au terme de chaque intervalle,
- la méthode de Kaplan-Meier est préférée lorsque les effectifs étudiés sont peu importants car elle prend en compte chaque décès indépendament les uns des autres et les reporte sur la courbe pour marquer un palier, aussi la courbe sera peu lisible si elle présente beaucoup de décès.
1 - Principe d'une étude de survie :
Une étude de survie sert à calculer la variation, au cours du temps, de la probabilité de survie de patients à partir d'un instant t0. On intègre donc progressivement des nouveaux patients dans l'étude et, à certaines dates, on compte le nombre de personnes encore en vie, décédées à cause de la pathologie étudiée ou disparues de l'étude.
Toutefois, les patients ne rentrant pas tous simultanément dans l'étude (mais progressivement), au moment où on fera les "comptes", on n'aura pas le même recul pour tous les patients. Les méthodes de calcul actuariel et de Kaplan-Meier utilisent quand même l'information fournie par les patients à faible recul.
De même, les patients perdus de vue ne renseignent pas quant à leur durée de survie mais apportent néanmoins une certaine information qui sera extraite par les méthodes de calcul actuarielle et de Kaplan-Meier.
La méthode actuarielle de calcul de survie permet de tenir compte des patients pour lesquels on n'a qu'un faible recul par rapport à la durée totale de l'étude (ex : des patients qui ne sont rentrés qu'un an avant la fin d'une étude qui aura duré 10 ans). Toutefois, cette méthode ne fait les "comptes" qu'à des dates régulières et fixées par avance, elle néglige les détails offerts par l'étude entre 2 dates de "comptage". A l'inverse, la méthode de Kaplan-Meier calcule un nouvel indice de survie à chaque nouveau décès, toutes les informations intermédiaires sont donc prises en compte.
La méthode actuarielle exige, de par son mode de calcul, une condition à respecter : que la probabilité de survie soit indépendante du facteur temps, c'est à dire que celle-ci ne soit pas modifiée par l'apparition, en cours d'étude, d'une nouvelle thérapie susceptible de prolonger notablement la survie des patients.
Une étude de survie tient compte :
- du nombre de sujets qui entrent dans l'étude (quel que soit le moment de leur entrée),
- du nombre de sujets qui décèdent pendant la durée de l'étude,
- du nombre de sujets qui disparaissent de l'étude parce qu'ils sont perdus de vue, ou parce qu'ils décèdent d'une autre cause que celle qui rentre dans le cadre de la pathologie étudiée : on parle de sujets "Censurés".
Il faut donc connaître pour chaque sujet :
- ses dates d'entrée et de sortie de l'étude, ou la durée pendant laquelle le sujet a été maintenu dans l'étude,
- la raison ou l'évènement qui a justifié sa sortie de l'étude (déces, censure) ou s'il est toujours en vie à la fin de l'étude.
Les formats des données étudiés peuvent être de 2 types :
- format "Date d'entrée / Date de sortie" :
Nota bene : dans ce cas précis, les cellules contenant les informations relatives aux dates doivent impérativement être définies au format "Date" d'Excel grâce à la commande "Menu Format / Cellule".
2 - Lancement de la procédure de construction d'une Courbe de Survie
Il vous est tout d'abord demandé de préciser la méthode que vous souhaitez utiliser pour votre étude de survie (actuarielle ou Kaplan-Meier).
Puis, il vous faut préciser le type de format de votre étude (format "Date d'entrée / Date de sortie" ou format "Durée d'étude"). En fonction de votre réponse, la sélection des données sera un peu différente.
2.1 - Format "Date d'entrée / Date de sortie" :
Il vous faut sélectionner séparément les plages de cellules relatives aux dates d'entrée et de sortie des patients de l'étude. Il vous faut également sélectionner la plage de cellules relatives aux évènements justifiant la sortie des patients de l'étude, ainsi que le code symbolisant l'évènement "Décès" dans cette plage de cellules ("D" dans notre exemple) :

Nota bene : toutes les sélections de plages de cellules doivent comporter le même nombre de cellules, si ce n'est pas le cas un message d'erreur s'affichera.
Nota bene : si le caractère que vous avez précisé pour définir l'évènement "Décès" n'apparaît pas dans la sélection de la variable "Evènement", un message d'erreur s'affichera.
2.2 - Format "Durée d'étude" :
Il vous faut sélectionner la plage de cellules relative aux durées d'étude de chaque patient, en précisant parmi les 3 options si l'unité de mesure est le jour, le mois ou l'année. Il vous faut également sélectionner la plage de cellules relatives aux évènements justifiant la sortie des patients de l'étude, ainsi que le code symbolisant l'évènement "Décès" dans cette plage de cellules ("D" dans notre exemple) :
Nota bene : toutes les sélections de plages de cellules doivent comporter le même nombre de cellules, si ce n'est pas le cas un message d'erreur s'affichera.
Nota bene : si le caractère que vous avez précisé pour définir l'évènement "Décès" n'apparaît pas dans la sélection de la variable "Evènement", un message d'erreur s'affichera.
Il ne vous reste plus qu'à cliquer sur le bouton "Calculer et Dessiner".
3 - Résultats d'une Etude de Survie
3.1 - Méthode actuarielle :
En fonction des informations que vous aurez précisées concernant les dates ou durées d'étude, le logiciel va vous proposer une valeur qui va servir à définir la longueur des intervalles d'étude. Les "comptes" en terme de décès, de censure ou de survie seront effectués au terme de chaque intervalle. Vous avez la possibilité de modifier la longueur de cet intervalle en modifiant directement la valeur numérique ou en jouant sur les flèches "Haut/Bas".
Les résultats s'affichent toujours sur une nouvelle feuille et présentent, sur la partie gauche les données sélectionnées et classées au format "Durée d'étude", que le format initial des données ait été au format "Durée d'étude" ou au format "Dated'entrée / Date de sortie".
La partie droite de la feuille des résultats concerne la courbe de survie et les données numériques qui ont servi à sa construction. Sous la courbe, plusieurs cases à cocher vous propose d'afficher sur le graphique :
- les limites de l'intervalle de confiance à 95% de la fonction de survie (en rouge),
- la droite représentant la valeur médiane de survie ; l'intersection de cette droite avec la courbe de survie donne le temps (ou l'intervalle de temps) pour lequel l'indice de survie est égal à 0.5 (valeur centrale) (en vert),
- la fonction de risque (instantané de décès) qui décrit la dynamique instantanée du processus de mortalité (en jaune),
- le risque cumulé (de décès) (en marron).
Chaque point de la courbe marque la fin d'un intervalle d'étude dont la durée correspond à la valeur que vous avez définie dans la boîte de dialogue précédente.
Nota bene : le dernier intervalle peut être inférieur aux autres.

Sur la droite du graphique sont rappelées les informations majeures de l'étude de survie :
- le nombre de sujets intégrés dans l'étude,
- le nombre de sujets décédés,
- le nombre de sujets censurés,
- le nombre de paliers utilisés pour découper l'étude de survie,
- la durée de chaque palier (hormis le dernier),
- la durée totale de l'étude.
Le tableau présenté au dessous du graphique rassemble toutes les données numériques nécessaires à la construction des courbes du graphique, chaque intitulé de colonne étant renseigné par un commentaire visible en posant le curseur de la souris sur la cellule en question.
3.2 - Méthode de Kaplan-Meier :
Les résultats s'affichent toujours sur une nouvelle feuille et présentent, sur la partie gauche les données sélectionnées et classées au format "Durée d'étude", que le format initial des données ait été au format "Durée d'étude" ou au format "Dated'entrée / Date de sortie".
La partie droite de la feuille des résultats concerne la courbe de survie et les données numériques qui ont servi à sa construction. Sous la courbe, une case à cocher vous propose d'afficher sur le graphique les limites de l'intervalle de confiance à 95%.
Chaque palier de la courbe marque le décès d'un patient de l'étude. Les paliers peuvent donc être très "ramassés" ou largement dispersés sur l'ensemble de la courbe, d'où la raison pour laquelle la méthode de Kaplan-Meier est peu adaptée aux études de survie à fort effectif.

Sur la droite du graphique sont rappelées les informations majeures de l'étude de survie :
- le nombre de sujets intégrés dans l'étude,
- le nombre de sujets décédés,
- le nombre de sujets censurés,
- la durée totale de l'étude.
Le tableau présenté au dessous du graphique rassemble toutes les données numériques nécessaires à la construction des courbes du graphique, chaque intitulé de colonne étant renseigné par un commentaire visible en posant le curseur de la souris sur la cellule en question.
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Société
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